La formation à la recherche est organisée dans le cadre de l’Ecole doctorale et s’appuie sur les chercheurs, équipes et laboratoires rattachés à l’EPHE ainsi que les bibliothèques et ressources du Service commun de documentation.
Les travaux de recherche font l’objet de publications, notamment dans le cadre de collections d’érudition. Les Annuaires présentent principalement les comptes rendus des conférences en sciences humaines des enseignants chercheurs.